Hrabri nindži je od svog naređenja dobio naređenje da prodre u dvorac aristokrata i tamo ukrade dokumente. Vi u igri Ninja Run Up and Down pomažete mu u ovim avanturama. Vaš će lik morati trčati do dvorca cestom koja prolazi kroz određeno područje. Na putu će naići na razne zamke i čudovišta. Trčeći do njih morat ćete prisiliti svog heroja da skače i leti kroz zrak kroz sve te opasnosti.
