U drugom dijelu igre Counter Craft 2 nastavit ćete sudjelovati u neprijateljstvima između različitih frakcija koje se odvijaju u Minecraft svijetu. Na početku igre naći ćete se na početnoj lokaciji gdje možete odabrati oružje po svom izboru. Nakon toga bit ćete prebačeni na određeno mjesto. Morat ćete vješto kontrolirati lik i potajno krenuti naprijed. Da biste to učinili, koristite značajke reljefa, zgrade i razne predmete razbacane posvuda. Čim primijetite neprijatelja, usmjerite oružje prema njemu i, uhvativši ga, otvorite vatru za ubijanje. Pucajući precizno, uništit ćete neprijatelja i za to dobiti bodove. Nakon smrti neprijatelja, morat ćete pokupiti trofeje koji će s njega pasti.