Nisu uvek i ne odmah ljudi spremni da prihvate one koji su drugačiji od njih, isto važi i za superheroje. S jedne strane, oni štite ljude od zlikovaca, ali njihova pretjerana snaga i neobične sposobnosti plaše, što ako heroj stane na stranu tame i tada neće svi biti zdravi. U igri Super Hero Masters, različiti super heroji će se boriti protiv armije ljudi koji ne žele da rizikuju. Međutim, nemaju šanse. Borićete se u prvom licu protiv raznih heroja Marvelovog univerzuma: Spider-Man, Superman, Archer, Iron Man i drugi. Svaki put kada trebate upotrijebiti svoje sposobnosti: izbacite mrežu, pucajte iz luka. Bacajte vatrene lopte i tako dalje u Super Hero Masters.