U drugom dijelu igre MathPup's Adventures 2, nastavit ćete sakupljati magične kosti razbacane oko smiješnog šteneta. Ispred vas, vaš lik će biti vidljiv na ekranu, koji će se nalaziti na određenoj lokaciji. Koristeći kontrolne tipke kontrolirat ćete radnje svog lika. Koristeći kontrolne tipke, natjerat ćete heroja da se kreće naprijed na lokaciji. Na putu vašeg heroja naći će se neuspjesi, prepreke i razne zamke. Vi, kontrolirajući heroja, morat ćete preskočiti neke od njih, a neke zaobići. Također, vaš heroj će morati izbjeći sudar sa čudovištima koja se nalaze u tom području. Da biste ih uništili, morat ćete natjerati svoje štene da im skoči na glavu.