Pustinja je područje sa teškim vremenskim uslovima. Ovdje je nepodnošljivo vruće danju, a užasno hladno noću. Raditi parkour na ovakvom mjestu je samomučenje. Stoga, junak u 3D Desert Parkouru ne trči punom brzinom kroz pješčanu dolinu svojom voljom. On treba da dođe do svog naroda kroz teritoriju na kojoj su se nedavno vodile bitke i gde bi moglo doći do pucnjave. Heroj će brzo trčati, ali na svom putu može naići na betonske barijere, razbijene tenkove, pa čak i laserske zamke. Kontrolirajući strelice, morate natjerati heroja da spretno savlada prepreke i tada će moći trčati daleko u 3D pustinjskom parkuru.