Ljudi su počeli da nestaju u podzemnim skladištima. Skladišta su uglavnom prazna, ali su ih s vremena na vrijeme posjećivali stražari i nekoliko ih je već nestalo. U igri Anaconda at the Backrooms preuzet ćete ulogu velike zmije anakonde. Slučajno se popela u podzemne prostorije i ni sama nije zadovoljna zbog toga. Ona želi da pobegne odatle što je pre moguće, a zmija je prilično gladna, pa će napadati i ljude koji se u tom trenutku nađu u pomoćnoj prostoriji. Na svakom nivou, zmija mora uhvatiti određeni broj žrtava. Ljudi će pokušati pobjeći, ali u zatvorenom prostoru i dalje su osuđeni na propast u Anacondi u Backroomu.
