Nakon niza katastrofa koje je izazvao čovjek, ekologija planeta se jako pogoršala, a ljudima je postalo teško živjeti. Pojavili su se mutanti koji su se brzo prilagodili novim uslovima. Njihova krv bi mogla postati osnova za stvaranje vakcine koja će pomoći običnim ljudima da postanu jači i zdraviji. Junak igre Mutant Blood je svjetski poznati naučnik koji je ujedinio sve pametne glave na planeti kako bi stvorio vakcinu. Počeo je rad u svim tajnim laboratorijama, ali su se pojavili oni koji žele da ometaju proces u Mutantblood - to su ekstremisti.
